当下出现的人工合成豆腐则是用大豆分离蛋白、变性淀粉和白色素搅拌沉淀制成。据了解，大豆分离蛋白是以低温脱溶大豆粕为原料生产的一种蛋白类补充品，常应用于饮料、营养食品、发酵食品等食品行业中。变性淀粉是一种改性的可食用淀粉，而“白色素”是一种无毒、无味的白色粉末，常用于食品增白。这种用大豆分离蛋白制成的豆腐有点类似冰冻豆腐，含有丰富的气孔。
总之，这种豆腐虽然口感没有特别不适，但它不仅没营养，还添加了色素和食品添加剂，多吃无益。
出于对这种现象忧虑，大量秉持着绿色健康观念的现代石磨豆腐生产企业出现，如河南省巩义市大作坊石磨城，其生产方式结合传统石磨与现代的电力技术，用电能推动原始的石磨磨盘，经过过滤、软化的生产用水，优质的大豆经过石磨研磨、渣浆分离、卤水点制、高压压制等一道道工序，产出的豆腐色泽微黄而有质感，其质量不输于传统石磨豆腐而产量过之。
与此同时还有其他一系列配套产品，如石磨豆浆，石磨磨豆浆和能量的释放有关，石磨磨齿均匀运转速慢，能让外界的空气与磨出来的豆浆颗粒很好的接触，在一定的化学作用下，能使让黄豆充分释放蛋白质，石磨本身含有多种矿物质与大豆自然摩擦，矿物质营养元素进入豆浆蛋白中，天然混合，浑然一体。这使豆浆既均匀又细，而且味美异常。
现代豆腐生产纯以机器完成，生产流程中无论是冲浆还是点卤都会加入添加剂以求色泽与产出速率，口感与营养价值都要逊于传统石磨豆腐，而现代石磨技术的出现使得传统石磨豆腐的健康生产方式最大程度的保留下来，同时又降低了生产成本提高了产量，与市场上新近出现的为降低成本而加入大量添加剂的合成豆腐形成了鲜明对比。
